【蛋白質組學】技術介紹及3-10分的文獻思路介紹
3-10分的文獻思路介紹
蛋白質組學技術介紹
蛋白質組學技術於1996年由澳大利亞學者Wilkins等最早提出。蛋白質組（Proteome）壹詞源於蛋白質（protein）與 基因組（genome）兩個詞的組合，意指“壹種基因組所表達的全套蛋白質”，即包括壹種細胞乃至壹種生物所表達的全部蛋白質。
蛋白質組學優於轉錄組學技術？
① 技術創新性較高： 蛋白質組學技術起步相對晚，仍處在技術紅利期中
② 不壹樣的研究視角： 從DNA、mRNA到蛋白質，存在三個層次的調控，即轉錄水平調控，翻譯水平調控，翻譯後水平調控。即使是相同的實驗設計，我們也可以換壹種科研技術來進行補充研究，闡明在生理或病理條件下的變化情況。轉錄水平調控並不能全面代表蛋白質表達水平。實驗也證明，組織中mRNA豐度與蛋白質豐度的相關性並不好。蛋白質復雜的翻譯後修飾、蛋白質的亞細胞定位或遷移、蛋白質－蛋白質相互作用等則幾乎無法從mRNA水平來判斷。所以蛋白質水平研究有其獨特的科研意義。
③ 藥物直接作用的靶點： 蛋白質是生理功能的執行者，是生命現象的直接體現者，是藥物作用的靶點。蛋白質組學的研究，有助於篩選到真正的驅動基因和潛在藥物作用靶點。
實驗設計建議
（1）方案壹 —— 蛋白質組學+差異蛋白表達量驗證
該思路是目前3~5分期刊中最常見的，也是最基礎的壹種研究思路。這類思路簡單、實驗難度相對低、以組學數據為主要實驗結果，甚至不涉及常規的基礎實驗，具有“短、平、快”的特點。建議實驗設計如下所示：
方案二 —— 蛋白質組學+差異蛋白功能驗證
該思路是對方案壹進行了延伸。較前壹種研究思路增加了對目標差異蛋白基因進行功能研究的實驗，即通過對目標蛋白基因的敲減或過表達，在細胞水平或/和動物水平檢測目標基因操作後產生的功能表型變化，以此明確目標蛋白基因的功能。建議實驗設計如下所示：
方案三 —— 目標基因A的機制研究方案
雖然 A基因通過調控B機制在C疾病中發揮D功能 不能解釋所有的科學問題，但卻是最常見、最容易被理解的壹種底層科研邏輯，因此想要設計個相對更完整的實驗方案，不妨順著ABCD著手，後續根據實驗情況再做補充和完善。建議實驗設計如下所示：
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