新壹代測序原理及意義是什麽怎樣理解高通量及操作簡單?
新壹代(第二代)測序技術的測序原理是“邊合成邊測序”.
先把基因組打斷成100kb左右的小片段,每個片段單獨測序,測完以後依靠大型計算機進行拼接,所以新壹代測序儀測序簡單,難在拼接.
測序時,以待測DNA片段為模板,進行互補鏈的合成,每延伸壹個堿基就進行壹次激光掃描,讀出是哪種堿基(四種堿基事先進行不同標記,在激光下呈現不同顏色),很方便地就完成了測序.
高通量體現在壹次上機能測的樣本數,第壹代測序儀壹次上機僅能測96個樣本,第二代測序儀壹次上機能測數萬個樣本.
操作簡單體現在機器自動化.
新壹代測序的意義,是實現了高通量、低成本、快速、操作簡便,為開展大規模物種測序及人類基因組研究提供了可能.,10,
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難怎樣準確的拼接?樣本量不太大(<15)的時候跟壹代測序優缺點在哪? 難以拼接是因為樣本打斷得太小了。像人類基因組大小是3G,打斷成100kb,相當於是打成了3萬個片段,用3萬個片段去拼出壹個完整的人類基因組,計算量及復雜程度可想而知。 樣本量很小的時候二代測序沒有任何優勢,反而會成本很高。 二代測序的最突出優勢就是高通量,只有很多樣本批量上機時,成本才能降下來。壹代測序就顯得很靈活,樣本量多少不會牽涉到成本。,