寡核苷酸探針的非放射性標記
寡核苷酸探針的非放射性標記時,可用以下幾種方法
1.酶延伸法合成與探針目的基因的3’-端壹段互補的寡核苷核序列,此序列的5’-端多加壹個A,與目的基因片段退火,再用Klenow酶延伸,使bio –dUTP摻入探針的3’末端。
2.5’磷酸末端標記法帶5’-磷酸的寡核苷酸探針,在咪唑緩沖液中用水溶性碳二亞胺(EDC)處理,可生成活性的磷酸咪唑中間體,與過量的乙二胺作用,就可以引入壹個帶氨基的接臂。用活化生物素標記就可以得到5’-磷酸標記的寡核苷酸探針。
3.酶標探針法用雙功能聯接劑如辛二酸雙羥基琥珀亞胺酯聯接寡核苷酸和堿磷酶,可以生成1:1的酶標寡核苷酸探針。此法省略了生物素-親合素中間步驟,可減少非特異性反應。
4.生物素酰肼胞嘧啶修飾法在亞硫酸鹽催化下,生物素酰肼可置換寡核苷酸探針中胞嘧啶上的氨基而得生物素化寡核苷酸探針。
5.寡核苷酸的酶促加尾標記法在末端轉移酶的作用下,用非放射性物質修飾的核苷酸(生物素dATP;生物素-dUTP;地高辛-dUTP)可加到DNA的3’末端,每個探針DNA可加上10~20個修飾堿基。
(1)取-0.5ml矽化塑料離心管,插入冰浴中,加入寡核苷酸(3pmol)×μl,5×加尾緩沖液20μl,5.0mmol/l dUTP 4μl(終濃度200μmol/L),修飾的dNTP(生物素-dUTP;生物素-dATP;地高辛-dUTP)×μl(終濃度100μmol/L),加入至100μl,混勻後加入末端轉移酶5u。37℃反應1h。
(2)探針純化:乙醇沈澱法:加入50μg tRNA,15ul 4mol/L醋酸鈉和375μl無水乙醇,混勻,-20℃1h,高速離心10min,棄上清,用70%乙醇和無水乙醇再反復洗沈澱,晾幹,再溶於水中,濃度為500ng/ml。