(1)概述:NGS測序在病原微生物檢測中的應用。
繁衍、變異、自然選擇、生存鬥爭,都是所有生物必須經歷的事情。
因為生命的第壹意義是生存。
為了生存,必須有鬥爭。生物之間存在著對資源的爭奪,生物與自然環境之間也存在著爭奪。在這個過程中,有些微生物可以和人類和平相處,甚至互利互惠,而有些則會讓人生病,通常是細菌、真菌、病毒、支原體、衣原體。這些是臨床病原微生物。
物競天擇需要壹個漫長的過程,但近年來,環境汙染和藥物濫用加速了病原微生物的進化,耐藥菌和超級細菌的出現嚴重威脅著人類健康。
還有壹些微生物,原本和人類沒有交集,原本只存在於自然界。有些人出於好奇而食用野生動物,從而將這些動物攜帶的病毒帶到了人類社會。比如本世紀初的非典病毒就是壹個例子。這種新型病毒對公共健康構成了巨大的挑戰,個人的貪婪給全世界人民帶來了巨大的災難。
當健康受到威脅時,人類發明了抗生素、病毒和抗病毒藥物來對付細菌。但如何治療,第壹步是找出元兇,臨床上往往很難做到。
傳統的血常規或器官組織的影像學指標可以判斷感染的可能性,但不能作為診斷的依據。比如血常規只能告訴妳有沒有細菌或病毒感染,卻不能告訴妳是什麽細菌或病毒。需要進壹步檢查才能確診,才能對癥下藥。
實驗室檢查,如抗原檢測、核酸檢測、代謝物檢測和毒素檢測,是識別感染、指導治療和判斷預後的重要手段。
為了克服傳統方法的缺點,新壹代測序技術(ngs)在病原微生物檢測中的應用具有很大的優勢,如:
當然,NGS也有壹些缺點:
即使有缺點,ngs也有更明顯的技術優勢。在鑒定難以培養甚至難以分離的疑難微生物和稀有細菌,特別是在新病原微生物的爆發和疫情監測中,NGS快速、準確、分辨率高,成為病毒鑒定的金標準,在流行病學分類中發揮重要作用。
新型冠狀病毒(2019,冠狀病毒肺炎-19)正在全球肆虐。目前沒有疫苗,也沒有特效藥。人們別無選擇,只能戴口罩,註意個人衛生,增加社交距離。面對肆虐的疫情,我們應該再次提醒人類,放下對宇宙的傲慢,因為微生物是當之無愧的地球之王,它們就在這個星球上。
我們不能也不應該試圖消滅所有的微生物。我們的關系不僅僅是對抗,更是合作,但是當我們的健康受到威脅的時候,我們也要勇於抗爭。
自然選擇,適者生存,人類與微生物的合作與鬥爭,必將永遠進行下去。