活性肽的分類
乳肽主要是由動物乳中的酪蛋白和乳清蛋白經酶水解制得。比原蛋白更易溶於水，更易被人體消化吸收，且耐酸、耐熱、滲透壓低。它是活性肽中需求量最大、應用最廣泛的保健食品原料。
大豆肽是由大豆蛋白酶水解制備的。具有低抗原性、抑制膽固醇、促進脂質代謝和發酵的作用。用於食品中，能快速補充蛋白質來源，消除疲勞，並作為雙歧桿菌增殖因子。
玉米肽是由玉米蛋白酶水解制備的。具有抗疲勞、改善肝、腎、胃腸疾病患者營養、促進酒精代謝的作用，可作為解酒食品。
豌豆肽是由豌豆蛋白酶解而成。口感溫和，價格低廉，可用於嬰幼兒配方奶粉。
蛋清肽由蛋清酶解而成。具有易消化吸收、低抗原、耐熱的特點，可用於流動食品、營養食品或糕點中。
動物源性肽是由家畜的肌肉、內臟和血液中的蛋白質經酶解制成的。比如脫脂牛肉酶解制成的牛肉肽，含有高支鏈氨基酸和肉堿，是壹種低熱量的蛋白質補充劑；新鮮豬肝經酶解、脫色、脫腥、超濾精制得到肝肽，可作為嬰兒食品、飲料、糕點等的促鐵吸附劑。酶解豬血制備血紅蛋白肽，可用於各種食品。
水產肽是由各種魚類蛋白水解得到的肽，如沙丁魚肽，是血管緊張素轉換酶抑制肽，不含苦味，可用於制作保健食品或防治高血壓的制劑。
蠶絲蛋白肽由蠶繭蠶絲蛋白經酶解制得的低肽具有促進酒精代謝、降低膽固醇、預防癡呆癥等多種功能。可用於醒酒食品和特殊保健食品。
復合肽從動植物、水產品、畜產品等蛋白質混合物中制備的復合肽。具有改善脂質代謝的作用，可用於各種保健食品中。
根據活性肽的保健功能，有容易消化吸收的肽:主要是二肽、三肽等低肽，消化吸收比氨基酸快，吸收率高，抗原性和滲透壓低，不會引起過敏、腹瀉等不良反應。適用於胃功能低下、消化道疾病術後恢復的患者，運動員、嬰幼兒、老年人的耐力滋補食品。
抗菌肽又稱抗微生物肽，在自然界中分布廣泛，在原核生物和真核生物中都存在。如植物、微生物、昆蟲、脊椎動物，在受到微生物感染時可以迅速合成，也可以通過基因克隆技術產生，如乳酸鏈球菌素，具有很強的殺菌作用。抗菌肽主要用於食品防腐。
嗎啡片肽來源於動物乳中酪蛋白、乳清蛋白和乳球蛋白的分離以及血紅蛋白和植物蛋白酶的水解。它是最早的食物蛋白肽，具有緩解疼痛、調節人體情緒、呼吸、脈搏、體溫、消化系統和內分泌的功能。
用胰蛋白酶從牛奶K-酪蛋白中分離出嗎啡樣拮抗肽，拮抗嗎啡樣肽，具有抑制血管緊張素轉換酶和平滑肌收縮活性的作用。
血管緊張素轉換酶抑制肽(簡稱ACEI肽)從天然蛇毒中分離出來，經細菌膠原酶水解，降解膠原蛋白或牛酪蛋白、大豆、玉米、沙丁魚、磷蝦蛋白等。ACEI肽是壹種血管緊張素轉換酶抑制劑，具有顯著的降血壓作用。其低肽易消化吸收，具有促進細胞增殖和改善毛細血管通透性的作用，可作為具有降壓功能的食品基料。
植物蛋白如大豆，可抑制膽固醇，由胃蛋白酶或胰酶制備，具有高疏水性，可刺激甲狀腺素的分泌，促進膽固醇的膽汁酸化，增加膽固醇的排泄，可用作降低膽固醇的保健食品。
促進礦物質吸收的肽主要是動物乳中的酪蛋白經胰蛋白酶作用生成的酪蛋白磷酸肽(CPP)，具有促進鈣、鐵吸收的作用，可用於兒童食品、老年人食品、抗乳糖過敏酸奶等產品中。
機體防禦功能肽，如谷胱甘肽，由微生物細胞或酶合成，也可由重組大腸桿菌產生，具有許多重要的生理功能。
苦味肽是蛋白質酶解產物中的苦味物質，由壹些疏水基因和疏水氨基酸組成。可以被活性炭吸附，也可以被末端肽酶、乳酸菌、釀酒酵母等壹些微生物進壹步水解。去除或減輕苦味後，其必需氨基酸含量高於酶解產物，營養價值更大，可作為食品營養強化劑。
用於預防和治療肝性腦病的肽，如F值寡肽，通過動物或植物的蛋白水解制備，用作預防和治療肝性腦病的藥物、保護肝臟的保健食品或抗疲勞食品。